Ve fakultním časopise Buď FIT vyšel článek o projektu Data Stewardship Portal, na kterém pracujeme v rámci našeho působení v evropské platformě ELIXIR.
Celý článek si můžete přečíst zde: casopis.fit.cvut.cz/technologie/data-stewardship-portal-aneb-informatika-pomaha-vedam-zive-prirode/
V rámci našeho působení v ELIXIR-CZ a ve spolupráci s ELIXIR-NL pracujeme na projektu Data Stewardship Portal, který má za cíl zefektivnění a zkvalitnění tvorby Data Management plánů primárně pro věděcké projekty z oblasti life science.
Tento projekt jsme jeli prezentovat na ELIXIR All Hands 2017 do Říma, kde jsme během vlastního 4 hodinového workshopu představili náš přístup i plány do budoucna. Účastníci měli možnosti si vyzkoušet práci s předběžnou verzí portálu i jak upravovat a vytvářet jeho obsah. Během workshopu i předchozí poster session jsme dostali nejen pozitivní ohlasy, ale i zajímavé podněty a nápady.
Můžete si prohlédnout agendu workshopu s prezentacemi, fotografie a náš poster:
Video introduction to ELIXIR je nyní dostupné na stránkách ELIXIR. Další videa o konkrétních oblastech činnosti v rámci ELIXIR budou následovat v příštích měsících.
Dne 24. 8. 2016 prezentovali Robert Pergl a Peter Uhnák článek o naší otevřené modelovací platformě OpenPonk, dříve známé jako DynaCASE, na letošním ročníku konference ESUG (European Smalltalk User Group), která se konala u nás v Praze na ČVUT, v rámci bloku IWST (International Workshop on Smalltalk Technologies). I pokud jste na konferenci nezavítali nebo prezentaci nestihli, tak máte možnost si ji prohlédnout zde.
Hned další den Peter Uhnák prezentoval samotnou platformu OpenPonk v rámci hlavního programu konference ESUG 2016. Samozřejmě i tuto prezentaci si můžete prohlédnout zde.
Formetis Consultants, náš holandský průmyslový partner a sponzor, pozval studenty pracující na tématech enterprise engineering do jejich centrály v Bextelu, Nizozemsku. Prezentovali jsme naši práci a na oplátku jsme dostali cennou zpětnou vazbu i podporu CEO Stevena van Kervela. Na náš pokrok se přijel podívat také Prof. Jan Dietz. Probíraná témata byla:
Měli jsme také velmi příjemnou společenskou akci se skvělým belgickým pivem :-). Děkujeme Vám, Formetis, za Vaši milou podporu a pohostinnost!
Máš zájem? Podívej se na nabízená témata a/nebo kontaktuj robert.pergl@fit.cvut.cz
Infrastruktura ELIXIR (European Life-Science Infrastructure for Biological Information) vznikla za účelem vytvoření a propojení distribuované výzkumné infrastruktury pro skladování, zpracování a analýzu dat z živých věd (Life Sciences). Reaguje na rostoucí potřeby výzkumné komunity, která generuje velký a exponenciálně rostoucí objem dat, která je třeba uchovávat, efektivně z nich extrahovat klíčové informace a zpřístupňovat. Česká republika se stala jedním z prvních členů konsorcia a v současné době je zapojena do řady aktivit v rámci konsorcia.
Bioinformatika má na ČVUT svoje pevné místo, především v podobě Fakulty biomedicínského inženýrství i aktivit na dalších fakultách. Na FIT se jedná o výzkum vyhledávání komprese sekvencí DNA pomocí slovníkových metod a přibližné vyhledávání vzorů v genomech (výzkumná skupina Pražský stringologický klub). Nejnověji se do aktivit zapojilo i Centrum pro konceptuální modelování a implementace, které zahájilo spolupráci v rámci ELIXIR-CZ na zvýšení interoperability bioinformatických dat – snahu, která je velmi aktuální např. v Holandsku, Slovinsku a dalších zemích infrastruktury ELIXIR. Posun v této oblasti představuje především aplikování ontologických metod v kombinaci se softwarovými nástroji.
ELIXIR-CZ čeká v roce 2016 velký rozvoj jak řešených témat, tak infrastruktury (technologie, spolupráce, projekty, financování). Zapojení ČVUT a FIT přináší významné příležitosti pro naše výzkumníky i studenty.
Převzato z fakultního časopisu Buď FIT (podzim 2015, strana 34)
Konkurz Laboratoře bioinformatiky MBÚ AVČR. Více v příloze.
CCM sdílí s ForMetis nadšení pro inovace v oblasti Enterprise Engineering a IT technologií založených na metodě DEMO. V současnosti nám běží tyto společné projekty:
Společné úsilí FIT a Profinit bylo úspěšné v žádosti o projekt financovaný Technologickou agenturou ČR. Projekt se jmenuje „Nástroje pro automatizaci zajišťování kvality rozsáhlých business inteligence systémů a datových skladů„.
CCM je součástí FIT projektového týmu. Naší prací je několik konceptuálních témat zabývajících se analýzou, designem a také realizace. Sledujte naše webové stránky pro další novinky.