Archiv pro rubriku: Projekty

ELIXIR-CZ – výroční konference 2017

I letos jsme se zúčastnili výroční konference ELIXIR CZ v Třešti. Prezentovali jsme naše působení v platformě Interoperability, kde pracujeme mimo mezinárodního projektu Data Stewardship Portal i na dalších projektech jako je například tvorba ontologií a uplatnění UFO (A a B) v doméně dárcovství kostní dřeně. Naši prezentaci si můžete prohlédnout níže společně s fotografiemi z akce.

Pokud Vás naše práce v ELIXIR zajímá, podívejte se na vypsané závěrečné práce nebo nás kontaktujte…

elixir_cz_annual_conference-2017_DSP

Portál OntoUML.org byl spuštěn

Dnes, 10. října 2017, přesně  v 10:10 (UTC) je klíčový okamžik pro OntoUML. Společně se zahraničními kolegy jsme spustili dlouho očekávaný komunitní portál OntoUML.org, který je nejen plný užitečných informací o ontologii UFO a jazyku OntoUML (vyučujeme na naší fakultě v předmětu BI-KOM, dříve BI-OMO), ale umožňuje také vyhledávat a sdílet názory, zkušenosti a projekty ostatních uživatelů. Představuje místo, kde by se soustřeďuje veškeré know-how spojené s OntoUML, místo, které velmi dlouho chybělo a nyní doufáme, že pomůže v rozšiřování a vývoji jazyka i základní ontologie, jejíž vývoj byl odstartován publikací dr. Guizzardiho v roce 2005.

Již nyní máme spoustu nápadů a plánů na rozvoj a zlepšování tohoto portálu a rádi uvítáme všechny, kteří se budou chtít do práce a OntoUML komunity zapojit!

ELIXIR CZ výroční konference 2017

Již druhá výroční konference ELIXIR CZ se bude konat 15. a 16. listopadu 2017 a my se opět chystáme na aktivní účast – prezentování naší práce, kterou v rámci působení v ELIXIR odvádíme ve spolupráci se zahraničními kolegy. Prezentaci si budete moci po konferenci tradičně prohlédnout na těchto stránkách, pro zatím se můžete podívat níže na plakát samotné konference a zvážit svou účast. Rádi se tam s Vámi potkáme!

elixir_cz_konference_poster_2017

 

NS letní škola 2017

V návaznosti na naši spolupráci (viz náš starší článek) s University of Antwerp se dva členové naší výzkumné skupiny, Marek Suchánek a Peter Uhnák, zúčastnili Normalized Systems Summer School 2017 v Antverpách. Během této velice zajímavé letní školy se naučili jak navrhovat, analyzovat, vytvářet a přizpůsobovat normalizované systémy a dále pracovali na jejich vlastních projektech souvisejících s NS teorií a nástroji, konkrétně v oblasti vizualizace, evolvabilních dokumentů a konceptuálního modelování. Oni, Dr. Robert Pergl, prof. Jan Verelst a prof. Herwig Mannaert mimo jiné společně probrali další rozšíření a zintenzivnění spolupráce mezi CCMi a FIT ČVUT v Praze, NSX spin-off a také Fakultou aplikované ekonomie – největší fakultou na antverpské univerzitě.

Tímto se otevírají nové perspektivy zajímavých témat závěrečných prací, výzkumných projektů a dalších zajímavých příležitostí. NS Summer School chceme zopakovat opět v příštím roce s více studenty a zároveň dále průběžně zlepšovat a prohlubovat naši vzájemnou spolupráci.

Zaujalo vás toto téma? Podívejte se na nabídku závěrečných prací nebo nás kontaktujte přímo emailem (perglr, suchama4)…

Data Stewardship Portal v Buď FIT

Ve fakultním časopise Buď FIT vyšel článek o projektu Data Stewardship Portal, na kterém pracujeme v rámci našeho působení v evropské platformě ELIXIR.

Celý článek si můžete přečíst zde: casopis.fit.cvut.cz/technologie/data-stewardship-portal-aneb-informatika-pomaha-vedam-zive-prirode/

DS Portal na ELIXIR All Hands 2017

V rámci našeho působení v ELIXIR-CZ a ve spolupráci s ELIXIR-NL pracujeme na projektu Data Stewardship Portal, který má za cíl zefektivnění a zkvalitnění tvorby Data Management plánů primárně pro věděcké projekty z oblasti life science.

Tento projekt jsme jeli prezentovat na ELIXIR All Hands 2017 do Říma, kde jsme během vlastního 4 hodinového workshopu představili náš přístup i plány do budoucna. Účastníci měli možnosti si vyzkoušet práci s předběžnou verzí portálu i jak upravovat a vytvářet jeho obsah. Během workshopu i předchozí poster session jsme dostali nejen pozitivní ohlasy, ale i zajímavé podněty a nápady.

Můžete si prohlédnout agendu workshopu s prezentacemi, fotografie a náš poster:

All_hands_ROME_2017_poster_FINAL

OpenPonk na ESUG’16

Dne 24. 8. 2016 prezentovali Robert Pergl a Peter Uhnák článek o naší otevřené modelovací platformě OpenPonk, dříve známé jako DynaCASE, na letošním ročníku konference ESUG (European Smalltalk User Group), která se konala u nás v Praze na ČVUT, v rámci bloku IWST (International Workshop on Smalltalk Technologies). I pokud jste na konferenci nezavítali nebo prezentaci nestihli, tak máte možnost si ji prohlédnout zde.

esug-openponk

Hned další den Peter Uhnák prezentoval samotnou platformu OpenPonk v rámci hlavního programu konference ESUG 2016. Samozřejmě i tuto prezentaci si můžete prohlédnout zde.

openponk-esug16

Navštívili jsme Formetis Consultants

FormetisFormetis Consultants, náš holandský průmyslový partner a sponzor, pozval studenty pracující na tématech enterprise engineering do jejich centrály v Bextelu, Nizozemsku. Prezentovali jsme naši práci a na oplátku jsme dostali cennou zpětnou vazbu i podporu CEO Stevena van Kervela. Na náš pokrok se přijel podívat také Prof. Jan Dietz. Probíraná témata byla:

  • The CIAO! App – diplomová práce Bc. Romana Lánského zaměřená na návrh jednoduché aplikace pro zasílání zpráv a správu úkolů založené na teorii PSI a implementaci prototypu.
  • Transformace DEMO modelů do BPMN – diplomová práce Bc. Ondřeje Mráze, která navazuje na práci Ing. Štěpána Hellera: snaha přivést striktnost metody DEMO do světa BPMN a naopak, poskytující intuitivní vizualizaci DEMO transakcí.
  • Probíhající práce na Action Model ve Formetis DEMO Engine vytvářené Bc. Markem Skotnicou v rámci jeho diplomové práce.
  • Bc. Peter Uhnák prezentoval náš projekt DynaCASE a diskutovali jsme součinnost s DEMO Engine.

IMG_1077

IMG_1019

Měli jsme také velmi příjemnou společenskou akci se skvělým belgickým pivem :-). Děkujeme Vám, Formetis, za Vaši milou podporu a pohostinnost!

Máš zájem? Podívej se na nabízená témata a/nebo kontaktuj robert.pergl@fit.cvut.cz

ČVUT se stalo členem konsorcia ELIXIR-CZ

ELIXIR-CZ logo

Infrastruktura ELIXIR (European Life-Science Infrastructure for Biological Information) vznikla za účelem vytvoření a  propojení distribuované výzkumné infrastruktury pro skladování, zpracování a analýzu dat z živých věd (Life Sciences). Reaguje na rostoucí potřeby výzkumné komunity, která generuje velký a exponenciálně rostoucí objem dat, která je třeba uchovávat, efektivně z nich extrahovat klíčové informace a zpřístupňovat. Česká republika se stala jedním z prvních členů konsorcia a v současné době je zapojena do řady aktivit v rámci konsorcia.

Bioinformatika má na ČVUT svoje pevné místo, především v podobě Fakulty biomedicínského inženýrství i aktivit na dalších fakultách. Na FIT se jedná o výzkum vyhledávání komprese sekvencí DNA pomocí slovníkových metod a přibližné vyhledávání vzorů v  genomech (výzkumná skupina Pražský stringologický klub). Nejnověji se do aktivit zapojilo i Centrum pro konceptuální modelování a implementace, které zahájilo spolupráci v  rámci ELIXIR-CZ na zvýšení interoperability bioinformatických dat – snahu, která je velmi aktuální např. v Holandsku, Slovinsku a dalších zemích infrastruktury ELIXIR. Posun v této oblasti představuje především aplikování ontologických metod v kombinaci se softwarovými nástroji.

ELIXIR-CZ čeká v  roce 2016 velký rozvoj jak řešených témat, tak infrastruktury (technologie, spolupráce, projekty, financování). Zapojení ČVUT a FIT přináší významné příležitosti pro naše výzkumníky i studenty.

Robert Pergl

Převzato z fakultního časopisu Buď FIT (podzim 2015, strana 34)