Infrastruktura ELIXIR (European Life-Science Infrastructure for Biological Information) vznikla za účelem vytvoření a propojení distribuované výzkumné infrastruktury pro skladování, zpracování a analýzu dat z živých věd (Life Sciences). Reaguje na rostoucí potřeby výzkumné komunity, která generuje velký a exponenciálně rostoucí objem dat, která je třeba uchovávat, efektivně z nich extrahovat klíčové informace a zpřístupňovat. Česká republika se stala jedním z prvních členů konsorcia a v současné době je zapojena do řady aktivit v rámci konsorcia.
Bioinformatika má na ČVUT svoje pevné místo, především v podobě Fakulty biomedicínského inženýrství i aktivit na dalších fakultách. Na FIT se jedná o výzkum vyhledávání komprese sekvencí DNA pomocí slovníkových metod a přibližné vyhledávání vzorů v genomech (výzkumná skupina Pražský stringologický klub). Nejnověji se do aktivit zapojilo i Centrum pro konceptuální modelování a implementace, které zahájilo spolupráci v rámci ELIXIR-CZ na zvýšení interoperability bioinformatických dat – snahu, která je velmi aktuální např. v Holandsku, Slovinsku a dalších zemích infrastruktury ELIXIR. Posun v této oblasti představuje především aplikování ontologických metod v kombinaci se softwarovými nástroji.
ELIXIR-CZ čeká v roce 2016 velký rozvoj jak řešených témat, tak infrastruktury (technologie, spolupráce, projekty, financování). Zapojení ČVUT a FIT přináší významné příležitosti pro naše výzkumníky i studenty.
Převzato z fakultního časopisu Buď FIT (podzim 2015, strana 34)